当公务员年度考核被确定为基本称职等次时，根据《公务员考核规定》和其他相关文件，会有以下几种处理方式：
组织处理
对被确定为基本称职的公务员进行诫勉，并责令其作出书面检查，限期改进。
如果连续两年被确定为基本称职等次，可能会予以组织调整或组织处理，具体措施可能包括停职检查、调整职务、责令辞职、免职、降职等。
影响级别和工资档次晋升
被确定为基本称职的公务员，在当年考核年度内不计算为按年度考核结果晋升级别和级别工资档次的考核年限。
影响职务职级晋升的任职年限
在被确定为基本称职的当年，不计算为晋升职务职级的任职年限，且在下一年内不得晋升职务职级。
取消评优资格
受到诫勉的公务员，取消当年年度考核、本任期考核评优和各类先进的资格，六个月内不得提拔或者重用。
不享受年度考核奖金
被确定为基本称职的公务员，不享受年度考核奖金。
其他可能的处理
对于连续两年被确定为基本称职等次的公务员，次年不计算为晋升级别工资和职务工资的考核年限；连续三年被确定为基本称职等次，或在三年中当年被确定为基本称职等次而后两年分别被确定为基本称职或不称职等次的公务员，予以辞退。
综上所述，被确定为基本称职等次的公务员将面临一系列不利后果，包括组织处理、影响晋升和薪资待遇、取消评优资格等。建议公务员在考核中认真对待，积极改进工作表现，以避免被确定为基本称职等次。
