在中国，发现屋顶违章建筑后，可以联系以下部门进行处理：
城市规划管理部门：
负责城市规划和土地利用管理，可以处理违章建筑和违建问题。
建设管理部门：
负责施工和建筑安全管理，可以处理违法违建问题。
房屋管理部门：
负责住房管理和相关法规执行，也可以处理违建问题。
国土资源管理部门：
负责土地使用和开发管理，可以对违建行为进行监督和处罚。
当地城管执法局：
接到12319城建服务热线举报后，会将举报信息转至属地城管执法局处理，并通知投诉人。
城建监察大队：
根据《中华人民共和国城乡规划法》等法规进行监察，负责处理违章建筑问题。
乡、镇人民政府：
对于乡、村庄规划区内的违章建筑，由乡、镇人民政府责令停止建设、限期改正，逾期不改正的，可以拆除。
建议您根据所在地的具体规定和实际情况，选择最便捷的部门进行举报或咨询。
